Diagnostyka molekularna chłoniaka Burkitta ad 6

Profil ekspresji genu nie był zgodny z diagnozą patologiczną w 8 z tych 26 przypadków (31 procent). Przeanalizowaliśmy także dziewięć przypadków, w których pierwotnie zdiagnozowano chłoniaka dużego rozlanego z dużych komórek B o wysokim stopniu złośliwości i które poddano weryfikacji pod kątem patologii jako takiej; jeden z nich został molekularnie sklasyfikowany jako chłoniak Burkitta. Tak więc, dziewięć przypadków z patologiczną diagnozą albo rozlanego chłoniaka z dużych limfocytów B, albo chłoniaka o wysokim stopniu złośliwości, nie wymienionego inaczej, miało profil ekspresji genu zgodny z chłoniakiem Burkitta (Figura 1D); przypadki te określane są w dalszej części jako przypadki chłoniaka Burkitta .
Ryc. 2. Ryc. 2. Wykonanie klasyfikatora molekularnego chłoniaka Burkitta dla przypadków z rozpoznaniem kolektywnym. Panel A pokazuje ekspresję genową dziewięciu przypadków rozszczepienia chłoniaka Burkitta (dla których diagnoza patologiczna i diagnoza molekularna nie zgadzają się). Ekspresja genów klasyfikujących chłoniaka Burkitta w tych próbkach jest porównywana ze średnią ekspresją tych genów w chłoniaku Burkitta i rozlanym chłoniaku z dużych limfocytów B (DLBCL). Względną ekspresję genu przedstawiono na podstawie pokazanej skali kolorów. Dla każdej próbki, immunofenotypu, wyniku Ki-67, ekspresji mRNA BCL2 (wartości przedstawiono na skali logarytmicznej z base-2), i fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH) dla translokacji w c-myc lub BCL2 podano w Dolny; znak plus oznacza obecność, brak znaku minus, a NA jest niedostępna. Dane barwienia BCL2 są wynikiem testów immunohistochemicznych dla białka BCL2. Jeden przypadek miał jednoznaczne barwienie białka BCL2, oznaczone znakiem plus-minus; ten przypadek został w analizie uznany za negatywny pod względem BCL2. Pokazano również prawdopodobieństwo, że każda z próbek jest chłoniakiem Burkitta, na podstawie ekspresji genów. Panel B ilustruje ekspresję genów klasyfikatora dla chłoniaka Burkitta w sześciu próbkach rozlanego chłoniaka z dużych komórek B, o których wiadomo, że mają translokację obejmującą gen c-myc, w porównaniu ze średnim poziomem ekspresji w chłoniaku Burkitta i dużym rozlanym Chłoniaka-B-komórkowego. Pokazano również prawdopodobieństwo, że każda z próbek jest chłoniakiem Burkitta, na podstawie ekspresji genów.
Rozbieżne przypadki chłoniaka Burkitta można łatwo odróżnić od wszystkich podgrup rozlanego chłoniaka z dużych komórek B na podstawie ekspresji genów. Prawdopodobieństwo, że te przypadki były chłoniakiem Burkitta według profili ekspresji genów wynosi 98 do 100 procent (Figura 2A). Ważność diagnostyki molekularnej chłoniaka Burkitta w tych dziewięciu przypadkach była potwierdzona obecnością translokacji c-myc (8; 14) we wszystkich z nich. Cztery z tych przypadków wyrażały względnie wysokie poziomy mRNA BCL2 i białka, a trzy wykazywały translokację (14; 18) oprócz t (8; 14). Pozostałe pięć przypadków rozszczepienia chłoniaka Burkitta było negatywnych pod względem BCL2 i było nie do odróżnienia od chłoniaka Burkitta na podstawie ekspresji genów.
Następnie zbadaliśmy, czy klasyfikator molekularny można zastosować do odróżnienia chłoniaka Burkitta od rozlanego chłoniaka z dużych limfocytów B z translokacją c-myc. Było zgodne z wcześniejszymi doniesieniami, że 7 procent przypadków pierwotnie zdiagnozowanych jako rozlany chłoniak dużych komórek B (6 z 87 zbadanych przypadków) miało translokację c-myc
[przypisy: twp wyszków, cezal kraków, rejs rypin ]